FLI
Vous trouverez dans cette rubrique les offres de stage, de thèses, de post doctorats, de CDD et CDI à pourvoir dans les laboratoires partenaires du réseau.
Liste des annonces
Post-doctoral position : Electrical property imaging by MRI
The objective of the project is to develop novel acquisition and reconstruction methods for imaging electrical properties (i.e. conductivity and permittivity) in-vivo in humans. MR-EPT (MR electrical property tomography) relies on the fact that electrical property changes throughout the patient result in a small - yet measurable - spatial modulation of the transmit and receive radiofrequency fields (B1+ and B1-). Various methods have been proposed based on B1+ mapping, phase images (spin-echo or bSSFP sequences), or ultra-short echo time sequences (UTE/ZTE). In previous work we have developed a new method based on a UTE sequence and a generalized reconstruction framework [1]. This involved solving a modified Helmoltz equation of the form ∆B/B κ^(-1)+∇B/B∙∇(κ^(-1) )≈iμ ω, with B^2 the complex UTE image and κ=σ+iωε_0 ε_R the complex admittivity (σ the conductivity, ε_R the relative permittivity). The aim of the project is to improve and further validate the technique for in-vivo application. In particular the following aspects can be investigated: robust denoising of the input data prior to Laplacian calculation, region-wise reconstruction using a prior segmentation from another imaging contrast (e.g. T1-weighted or T2-weighted), source separation methods to eliminate spin-density contrast in the raw UTE images.
[1] P Soullié et al., Magn Reson Med. 2021;85(2):762–76.
Ingénieur plateforme (12 mois)
Une plateforme IMOSAR FR 3616 (Imagerie en ostéo-articulaire pour la recherche) a été créée en janvier 2014 et renouvelée par l' HCERES en 2018 en association du B3OA et de Bioscar U 1132 Inserm. Elle associe des outils de recherche préclinique sur le petit animal et sur l'imagerie de pièces anatomiques ou de matériaux. Trois niveaux d'accès sont proposés : (i) mises à disposition des équipements après formation, (ii) collaboration scientifique, (iii) prestation de service. Une description détaillée de l'organisation et des équipements d'IMOSAR est disponible à https://www.imosar.cnrs.fr. La personne devra prendre en charge la partie de la plateforme dépendante du B3OA qui comporte les 2 appareils micro-scanner un Skyscan 1172 et Skyscan 1176. Le laboratoire B3OA regroupe des chirurgiens orthopédistes, des dentistes, des vétérinaires, une rhumatologue et des radiologues, des biologistes, des biochimistes et des ingénieurs. Le B3OA est affilié au Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), à l'Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), à l'Université de Paris, et à l'École Nationale Vétérinaire d'Alfort (ENVA).
Exploring the effect of photobiomodulation on brain activity using fMRI and MEG
Topic of the study: The series of experiments will focus on whether photobiomodulation, the use of red to near infrared light (λ=600-1000nm) on body tissues, can improve brain function in normal individuals, both young and older, with a view to it forming a preventative treatment for neurodegenerative disease, particularly Alzheimer's disease. The premise here is: by improving brain function in normal subjects, strengthening the functional connectivity between regions, the brain is in an healthier state and less likely to decline into dysfunction and disease with age. To these ends, brain function will be measured in individuals using fMRI (functional magnetic imaging) and MEG (magnetoencephalogram). A bespoke an extracranial photobiomodulation device will be used, one based on a device that is currently in use for Parkinson's disease patients (Hamilton et al 2019; Photobiomod, Photomed and Laser Surg 37:615–622). The results generated will provide insight into whether photobiomodulation influences overall brain activity and whether there are any major differences in its effect on young, as compared to older neural systems. The results will also form a key template for future study on the effect of photobiomodulation on Alzheimer's disease patients.
Validity: 1/01/2022 au 1/01/2025
Chef de projet pour le hub Paris Centre de France Life Imaging
-Coordination locale: création d'un comité de pilotage du Hub, incluant une représentation de toutes les plateformes et dirigée par le coordonnateur du hub; planification des réunions du comité de pilotage (avec ordre du jour et compte-rendu), liaison avec les actions des groupes de travail, y compris les appels d'offre pour projets collaboratifs émis par FLI.
-Liaison avec la coordination nationale de FLI: diffusion d'informations du Comité de Pilotage national de FLI lors des réunions de comité local, retour d'expérience du comité local vers le comité national, mises à jour annuelles de la feuille de route pour les besoins actuels et futurs en équipement d'imagerie. Collecte de métriques d'activité des plateformes telles que le taux d'occupation, estimations de coûts, profits externes, collaborations académiques, partenariats industriels, bibliométrie.
-Standardisation de la gestion des plateformes au sein du hub et avec les autres hubs: outils de reservation, métriques d'utilisation, gestion des partenariats (y compris partenariats industriels) -Communication: définition d'un service régional, collaboration avec les "pôles de compétitivité"
Le·a chef·fe de projet travaillera au sein de l'équipe Van Beers (laboratoire des biomarqueurs en imagerie, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inserm UMR1149 / Université de Paris), avec laquelle toute implication y compris scientifique sera encouragée. L'équipe scientifique est constituée de physiciens et de radiologues (Doctorants, chercheurs post-doctorants, Ingénieure de recherche et chercheurs permanents). Elle est focalisée sur les développements cliniques et précliniques de méthodes d'imagerie pour les maladies hépatiques et abdominales telles que la stéatohépatite non alcoolique, la cirrhose et le cancer, ainsi que les lésions inflammatoires et cancéreuses du pancréas. De nouvelles méthodes d'imagerie sont développées, certaines permettant la caractérisation biomécanique des tissus, la mesure des propriétés de dispersion du coefficient de diffusion ou d'autres méthodes avancées de relaxométrie (T1, imagerie de la graisse). L'équipe est également orientée vers le développement de méthodes statistiques ou d'apprentissage pour la classification non supervisée de données hétérogènes incluant les données d'imagerie.
Le contrat sera d'une durée de 1 an (renouvelable).
Post-doctoral fellowship in MRI
Project
The overall objective will be to develop and validate novel MR biomarkers of NASH. This goal will be pursued through preclinical, small animal and clinical imaging studies. Quantitative MRI methods that we develop and validate for NASH diagnosis in this research project include 3D multifrequency MR elastography, TDS, fat imaging and relaxometry.
Expected skills
The applicant (PhD or MD-PhD) should have demonstrable skills in any of the following areas: MRI, physics-based image analysis or biomedical imaging. Knowledge in radiology and hepatology is strongly encouraged. The applicant must be well organized, able to interact with people having many different levels and areas of expertise and be proficient in scientific experiment design, statistical analysis and scientific writing. The position involves French and English languages.
18-months postdoctoral position open on 01/11/2021 – In vivo MRI for therapeutic applications of metal chelation
A 18-months postdoctoral position is available at the Institute of Molecular Sciences in Bordeaux. The position is open in the “Molecular MR Imaging” group, head Dr. Yannick Crémillieux, in the framework of the research program SEMB (Selective extraction of metals from the brain) supported by the Agence Nationale de la Recherche (ANR). The objectives of the SEMB project are to implement new strategies for metal chelation in the brain that will be applied in diseases associated with deregulation of metal homeostasis. The research project of the recruited fellow will focus on the use of MRI and MRS for assessing the efficacy and the impact of metal chelation on animal models of neurodegenerative diseases. The research fellow will work in a multidisciplinary environment including MRI physicists, neuroscientists and chemists.
How to apply? Interested candidates should send their detailed CV and a cover letter by email to the attention of yannick.cremillieux@u-bordeaux.fr
CDD longue durée Chargé.e d’études in vivo
Description
Au sein de la direction Recherche et Innovation de GUERBET, vous intégrez le pôle d’Imagerie et Biologie. Vous assurerez l’avancement des études biologiques dans le domaine de l’imagerie diagnostique par IRM dans le cadre des programmes de recherche ou de projets de early développement (jusqu’à la phase I).
Vous aurez pour missions principales :
• Concevoir, mettre au point et réaliser des travaux expérimentaux de biologie et d’imagerie in vivo sur des modèles précliniques en autonomie totale
• Interpréter et exploiter les données et les paramètres collectés avec un sens critique et adapter si besoin, les procédures expérimentales
• Rédiger les protocoles et les rapports d'études des travaux réalisés
• Consigner les données brutes et les résultats sur les supports en vigueur (cahier de laboratoire, fichier informatique, ..)
• Garantir la fiabilité de ses résultats et identifier toutes anomalies ou non-conformité éventuelles
• Appliquer les consignes et instructions données en matière de santé, sécurité et environnement
• Mettre en œuvre et veiller à la maintenance et à la qualification des appareils de laboratoire
• Réaliser une veille technologique et bibliographique dans son domaine
En intégrant une équipe à taille humaine, vous serez impliqué(e) dans diverses missions relatives au pôle d’Imagerie et Biologie en lien avec les autres pôles de la recherche (Physico-chimie Formulation, Spectrométrie de masse/bioanalyse et Chemical Discovery)
Emploi Post-doc/ Organic chemistry/Radiochemistry and process/Chemistry engineering
The project is multidisciplinary and involves organic chemistry, radiochemistry of fluorine18, carbon-11 and radiometals and partly chemical engineering for the automation of the manufacturing processes. The project has 2 main objectives :
• the development of new radiosyntheses on a dedicated R&D module: evaluation of different reaction conditions to incorporate the radioactive isotope on the target molecule, protection/deprotection of sensitive chemical functions, development of purification methods, microfluidic transfer automation ...
• the optimization and validation of the fully automated robotic manufacturing system, from the production of the isotope to the syringe on the iMiGINE prototype installed at the SHFJ.
Programing and piloting the robot will first take place at PMB, without radioactivity, before being transposed to the system installed at the SHFJ. The project is conducted within a network of laboratories involved in the development of the iMiGINE system and is financed by the French Plan de Relance.
The proposed contract is for 12 months renewable once.
Applicants : Students with a PhD in organic chemistry, radiochemistry or chemical engineering interested in the automation of synthetic processes and the chemistry / medicine interface are strongly encouraged to apply. The PhD must have been obtained in 2019, 2020 or 2021 imperatively.
More info :
http://www.biomaps.universite-paris-saclay.fr/
https://www.pmb-alcen.com/fr
POSTDOCTORAL POSITION MRI PHYSICIST UHF – 7T TERRA
We have a vacancy for a 3-year postdoc position as part of an international collaboration project in ultra-high field MRI. The SCAIFIELD project is financed through the EU Joint Programme for Neurodegenerative Disease Research (JPND) and involves five partners from four countries (Belgium, Norway, Germany, and Turkey). The goal of the project is to establish quantitative 7 Tesla MRI biomarkers for Ataxia disease with high potential for detecting early disease manifestation and monitoring progression. Specifically, the postdoc position at GIGA-CRC-IVI will focus on the development of quantitative MRI sequences. The position will include both MR sequence programming and in-vivo experiments.
Responsibilities – main function
Implementation and analyses of quantitative MRI in collaboration with SCAIFIELD project partners and with the support of Siemens Healthineers (research and collaboration agreement).
At GIGA-CRC-IVI, a multidisciplinary team of researchers is involved in SCAIFIELD: Dr. Pierre Maquet (neurologist), Dr. Christophe Phillips (biomedical engineer), Dr. Gilles Vandewalle (biologist) and Dr. Christine Bastin (psychologist).
Post-doc Analytic Chemistry and Mass Spectrometry Imaging
CONTEXT
Positron Emission Tomography (PET) associated with radiotracers labeled a positron emitter is a powerful non invasive technique for functional, metabolic and quantitative imaging of relevant biomarkers. In the frame of the BIOMETMS project funded by CEA we aim to develop an innovative approach to improve the discovery of new tracers during the early steps of development including their biodistribution and determination of the uptake on the target of interest by mass spectrometry imaging. Implementation of these strategies will allow a more focused and rational PET ligand discovery effort to identify high quality PET ligands in particular for neuroimaging.
OBJECTIVES
The postdoctoral fellow will develop an innovative approach to study the biodistribution of tracers developed for positron emission tomography (PET) imaging in biological tissues. Based on mass spectrometry imaging techniques, the aim of the project is to detect, localize, identify structure and quantify new radiotracers and their metabolites in the tissues, in particular in the brain. Indeed, this powerful tool will allow the screening of a much larger number of candidates while offering the possibility of measuring their uptake on the targets of interest and this upstream of the radiolabelling steps of the ligands to maximize their chance of success in imaging and transfer in the clinic. The BIOMETMS project involves the recognized expertise of 2 academic laboratories : BioMaps (http://www.biomaps.universite-paris-saclay.fr) in the development of PET radiotracers and that of the UPR2301 in mass spectrometry imaging (https://icsn.cnrs.fr/recherche/cbsa/ms) and is done within the framework of a project fun