Network of Expertise 4: Multimodal Image Analysis (NE4)

Since the creation of FLI, the network of Expertise 4 (NE4) awarded 44 starting grants “Exchange of Expertise”, including 16 grants awarded since 2020. The average grant amount is ~16 k€. These grants were allocated to 41 different labs, for a total amount of 720,000 €. One specificity of the projects funded by NE4 is that half of them gather three different laboratories or more. They cover multimodal image analysis, image reconstruction for PET, PET-MR, MEG and Single Photon Counting Scanner, quantitative methods for MRI, AI.

The table below summarizes the expertise exchange projects awarded since 2014.

Year of award

Short title

Project title

Teams / Laboratories involved

2014

ReconsGPU

Reconstruction Tomographique Multimodale sur Architecture GPU

LaTIM UMR1101 Brest &  IPHC Strasbourg & SHFJ Orsay &  INCIA Bordeaux

2014

QuantifIRM

Quantification en IRM multimodale

U746 Empenn Rennes & Creatis Lyon & CRMBM Marseille

2014

Connect_LIS

Multi-modal MRI for functional, anatomical connectivity and volumetry quantification in syndrome of confinement patients

GIN Grenoble &  ICUBE UMR CNRS 7357 Strasbourg

2014

SCatlas

Multi-modality image based atlas of the spinal cord

Creatis Lyon & CRMBM Marseille

2015

MEG-Recons

Modelling the electromagnetic activity of deep sources in MEG and their projection in a template space for group analysis.

ICM Paris & CEA-LETI Grenoble & CERMEP Lyon & INT la Timone Marseille

2015

PIXSCAN-FLI

Méthodes de décomposition en base de matériaux et applications au scanner spectral PIXSCAN-FLI

Creatis Lyon & CPPM Marseille

2015

MR PET Quantif

Methods of quantification for combined MR PET imaging

LaTIM UMR 1101 Brest / CERMEP Lyon

2016

Multi-CS-MRI

Echantillonnage compressif pour l’imagerie par résonance magnétique multimodale. Applications en neurosciences.

NeuroSpin – CEA Saclay & UMR CNRS 7296 Marseille & INT Marseille & INRIA – Sophia Antipolis & UMR CNRS 5219 IMT Toulouse & Centrale – Supélec- INRIA GALEN Palaiseau

2017

Géopoumon

Analyse géométrique pour la caractérisation des maladies pulmonaires

LaBRI UMR5800 Bordeaux & LORIA Nancy & LAMA Université de Savoie

2017

Elasto USMRI

Conditions de validité de l’élastographie par ultrasons et par résonance magnétique – Calibration  multicentrique

IR4M, Orsay & IMIV SHFJ Orsay & CRI Paris

2017

Raxometry

Raxometry

GIN U1216 Grenoble & CRMBM Marseille & ICM-CENIR Paris

2017

qMRI – WP4

qMRI : Développement de méthodes d’IRM quantitatives innovantes

CRMBM Marseille & ICM-CENIR Parsi & ICUBE Strasbourg & IR4M Orsay, NeuroSpin Saclay

2017

Tti-tempo

Analyse d’images médicales multimodales et multi-temporelles à partir de connaissances

LIPADE, Paris Sud & IMIV-SHFJ Orsay & LTCI Paris & ICUBE Strasbourg & CRESTIC Nancy

2017

tomoCASToR

Harmonisation de l’implémentation algorithmique de la reconstruction tomographique à travers la plateforme CASToR 

IMIV SHFJ Orsay & LaTIM UM 1101 Brest & CRCNA CHU Nantes & CNRS UMR5287 Bordeaux

2018

VIVUS3D

Vélocimétrie intraventriculaire ultrasonore 3-D

CREATIS Lyon & UMR5149 Montpellier & CHU Caen

2018

CASToR

Exploitation et enrichissement de la plateforme de reconstruction tomographique CASToR à travers des applications multi-modalités et multidimensionnelles

SHFJ Orsay & LaTIM UMR 1101 Brest & CRCNA CHU Nantes & INCIA UMR5287 Bordeaux & UMR1253 Tours & CERMEP Lyon

2018

Raxometry II

 

GIN U1216 Grenoble & CRMBM Marseille & ICM-CENIR Paris & NeuroSpin Saclay & MIRCen Fontenay-aux-Roses & UMS 34 Bordeaux

2018

Tumor-Simu

Validation de la simulation numérique de croissance tumorale et réponse à la radiothérapie

LTSI Rennes

2018

AS-Rec

Appariement de supervoxels et analyse spectrale pour le recalage non-rigide d’images médicales multimodales

LaTIM UMR1101 Brest & ICUBE Strasbourg

2018

3Drec-TEP/CT

Correction de mouvement et reconstruction 3D pour l’imagerie multimodale dynamique TEP/CT simultanée du même champ de vue

CPPM UMR 7346 Marseille & INCIA CNRS UMR5287 Bordeaux

2018

US-IRM-optic

Imagerie multimodale US/IRM/optique de l’orientation des fibres cardiaques

CREATIS Lyon & Institut Langevin Paris

2018

MEG-model

Evaluation de la sensibilité de la modélisation des activités, électromagnétiques des sources profondes en MEG

ICM – CENIR Paris & CERMEP Lyon & CEA-LETI Grenoble & UMR1106 INS Marseille

2018

PIXSCAN-FLI

Décomposition en bases de matériaux pour le scanner spectral PIXSCAN-FLI par des méthodes d’apprentissage machine

CPPM UMR 7346 Marseille & CREATIS Lyon

2019

TEP bi-traceurs

l’imagerie TEP bi-traceurs, développement et évaluation préclinique

CRCINA CHU Nantes & LaTIM UMR 1101 Brest & CERMEP Lyon

2019

IRM-ColCar

Imagerie par résonance magnétique nucléaire (IRM) du collagène myocardique par cartographie T2* 3D multi-gradient d’écho

CRMBM Marseille & CREATIS Lyon

2020

MEG-PMLG

les Apports des magnétomètres à pompage optique pour la détection des activités électromagnétiques en MEG

CEA-LETI Grenoble & ICM – CENIR Paris & CERMEP Lyon &  UMR1106 INS Marseille

2021

CASToR Expansion

Exploitation et enrichissement de la plateforme de reconstruction tomographique CASToR à travers des applications multi-modalités et multidimensionnelles

 UMR1232  CRCNA CHU NANTES & SHFJ UMR 1023 Orsay & LaTIM UMR1101 BREST

2021

QuICS

Co-conception pour la reconstruction, l’ajustement et l’analyse d’images multiparamétriques QuICS

CRMBM Marseille & NeruoSpin Saclay

2021

DETECANO

Détection d’anomalies en neuroimagerie par apprentissage (profond) non supervisé

CREATIS Lyon & U1216 GIN Grenoble & Inria Grenoble

2021

3D TOMO

Co-conception of fast tomographic approaches for high quality 3D photoacoustic imaging

CNRS AMU UMR 7373 Marseille & CNRS UMR 7371  Paris

2021

3DIRM

Modelisation 3D de la dynamique pelvienne par IRM ultra-rapide

LIS UMR CNRS 7020 Marseille & CRMBM Marseille & ICB UMR6303 UT Belfort Montbéliard

2021

UHR PET

UHR-PET – Conception logiciel d’une console de contrôle de l’acquisition et de la reconstruction sur un prototype d’imageur TEP haute résolution dédié au cerveau

CERMEP Lyon & LaTIM UMR 1101 BREST

2021

GEODEEPLEARNING

Contraintes géométriques et topologiques pour la segmentation vasculaire par deep learning

LaTIM UMR 1101 Brest & CREATIS Lyon

2021

MEG-PMLG 2

Optimisation de la configuration d’un capteur MEG a base d’OPM a Helium 4 pour la localisation des sources

CEA-LETI Grenoble & ICM – CENIR Paris & CERMEP Lyon &  UMR1106 INS Marseille

2021

NANOAGENT

Nouveau nano-agents thérapeutiques photo-thermiques pour l’imagerie in vivo multi-spectrale photoacoustique

CREATIS Lyon & ISCR Rennes

2021

GAIIA

GAIIA (Optimisation de la double imagerie TEP/TDM au 68Ga-PSMA et au 68Ga-RM2 pour la radiothérapie stéréotaxique personnalisée guidée par l’image du cancer de la prostate)

INCIA BORDEAUX & CHU Bordeaux & CHU Poitiers & INRIA Bordeaux

2022

BRAVEHEART

Analyse d’images multimodales précliniques (SPECT et IRM) pour la détection de la dysfonction coronaire microvasculaire

LRB Grenoble & U1216 GIN Grenoble & CRMBM Marseille

2022

FLAG

Fusion multimodaLe et Apprentissage faiblement supervisé pour la seGmentation du cancer de la prostate

CREATIS Lyon & LaTIM U 1101 Brest

2022

GABA-MAP

Visualisation et quantification de données issues d’imagerie spectroscopique d’édition du GABA dans un modèle animal d’épilepsie focale

U1216 GIN Grenoble & CRMBM Marseille

2022

MODYPE 3D

Modélisation 3D de la dynamique pelvienne par IRM ultra-rapide

LIS UMR7020 Marseille & CRMBM Marseille & ICB UMR CNRS 6303 UT Belford Montbéliard

2022

POSITEP

Prise en compte de la durée de vie du positronium en imagerie TEP

IPHC Strasbourg & LaTIM U1101 Brest

2022

TRAIL

TRaitement d’Antenne pour la mIcroscopie par Localisation ultrasonore : de l’émission à l’application pré-clinique

CREATIS Lyon & LIB Paris

2022

VIGREST

Détection des variations de la vigilance en imagerie de résonance fonctionnelle de l’état de repos conscient.

UMR5293 Bordeaux & UMRS1075 Caen

2023

QSM_SpiCo

Développement QSM médullaire

Equipe Empenn, ERL U1228, INSERM-INRIA, IRISA UMR CNRS 6074, Rennes & Centre de NeuroImagerie de Recherche, Institut du Cerveau, Paris

2023

MIAM-FAST

Suivi des altérations métaboliques cardiaques au cours du jeûne thérapeutique par IRM

CREATIS & CRMBM

2023

DEEPMULTI

Deep Learning for Multimodal Image Reconstruction

LATIM INSERM U1101 BREST & CREATIS CNRS UMR 5220 – INSERM U1294 LYON

2023

CASToR_DTC

Extension de la plate-forme de reconstruction CASToR pour de nouvelles approches de détection porté

INSERM UMR1101 LaTIM & CHU Nantes/ CRCI2NA & CEA/SHFJ BioMaps

2023

ASAP

Augmentation de données par Simulation pour l’Apprentissage d’une méthode de correction d’atténuation TEP

CERMEP & LATIM

2023

IMSPONGE

Imagerie multimodale et élaStographie d’éPONGEs de collagène

ICUBE & LEM3

2023

GRENLAM

Grenoble et Rennes pour la localisation anatomique et fonctionnelle du langage et de la mémoire

IRMAGE GRENOBLE & Empenn Neurinfo

2023

PADL

Pre-therapeutic 68Ga-PSMA PET AI based Dose prediction for 177LuPSMA targeted radionuclide therapy

LaTIM & IADI

2023

DAISIES

Détection d’Anomalies en Imagerie Médicale par apprentissage faiblement Supervisé

INRIA Rennes & CREATIS Lyon & GIN Grenoble

2023

SEISMS

Segmentation intelligente et automatique musculaire des membres inférieurs : enrichissement et mutualisation d’images annotées et d’outils Web pour renforcer l’entrainement de méthodes d’apprentissage profond afin d’améliorer leurs performances

CRMBM Marseille & LIS Marseille

2023

INFINI

Analyse métabolique et quantitative de données multi spectrales cliniques obtenues par IRM du 31P : développement d’une approche de Filtrage multi spectral Non local Innovante

CREATIS & INRAE

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