Emploi

Vous trouverez dans cette rubrique les offres de stage, de thèses, de post doctorats, de CDD et CDI à pourvoir dans les laboratoires partenaires du réseau.

Liste des annonces

Ingénieur de recherche du programme ANDIMBA – CDD 18 Mois


BAP : BAP A : « Science de la vie, de la Terre et de l’environnement » / FAP « Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre »

Missions :
Adaptation et mise en œuvre d’outil de neuroanatomie informatisée, traitement et analyse de données IRM anatomiques, dans le cadre du programme ANDIMBA (ANR-19-CE17-0028-01, Spectre de l’Alcoolisation Fœtale : identification de marqueurs neuro-anatomiques en IRM), en collaboration avec l’investigateur principal et les investigateurs associés. La mission comprend la participation aux trois tâches suivantes du programme :
• adaptation d’outils de traitement d’images adaptés aux objectifs et données du programme
• traitement des images IRM pour obtention des paramètres neuroanatomiques d’intérêt
• identification de marqueurs par analyse normative et modélisation prédictive multivarié

Activités principales :
• Traitement des images IRM (patients, contrôles) pour estimation de paramètres d’intérêt :
- application d’un nouvel outil de mesure non supervisée du corps calleux (étude princeps)
- adaptation et application de 2 outils de segmentation des hémisphères cérébraux
• Analyse comparative (patients, contrôles) et intégrative des paramètres neuroanatomiques :
- modélisation des effets de taille et/ou de croissance pour analyse normative et identification de paramètres « candidat
marqueur »
- modélisation multimarqueur (classifieur, prédicteur…) incluant l’ensemble des résultats du projet ANDIMBA sur la base d’outils d’apprentissage informatisé

Activités associées :
• Contribution à l’étude d’autres paramètres ou structures neuroanatomiques (noyaux gris)
• Contribution éventuelle à l’encadrement des stagiaires en M2 du programme
• Contribution à la rédaction et publication d’au moins un article scientifique sur ces travaux

Spécificité(s) / Contrainte(s) du poste :
Site d’exercice : principalement à NeuroSpin (CEA-Saclay, Gif/Yvette), potentiellement à l’INT (Marseille) sous forme de mission, très accessoirement à hôpital Robert-Debré (Inserm U1141 NeuroDiderot, Paris 19e ), télétravail selon réglementation de l’Inserm.

Engineer position at the European Center for Research in Medical Imaging – Marseille


- Use of animals for scientific purposes: caudal, retroorbital, subcutaneous, intramuscular and intraperitoneal intravenous injection, fluid samples from living rodents (mice, rat);
- Handling of radiotracers (notions of decay, radiation protection);
- Preclinical isotopic imaging in vivo microSPECT/CT, microPET/CT: preparation of rodents, acquisition of static and dynamic images, image processing (reconstruction, quantification), presentation of imaging data for statistical analysis;
- Project management and quality assurance: general notions of project management and quality management, traceability, confidentiality / GDPR, in conjunction with the CERIMED quality unit.

Ingénieur Technicien Administratif Marseille CDD 12 mois

Imagerie isotopique préclinique in vivo microTEMP/TDM, microTEP/TDM : dans le cadre de prestations ou de projets collaboratifs de recherche portés par CERIMED avec le monde académique et industriel, l’ITA devra gérer en autonomie le prélèvement des doses individuelles de radiotraceur, l’administration aux rongeurs, l’acquisition microTEMP/TDM ou microTEP/TDM, le traitement des images ainsi que leur analyse statistique ;
Valorisation et diffusion : l’ITA sera en lien avec le représentant de CERIMED au COMEX de l’Institut CARNOT STAR ainsi qu’avec les chargés d’affaires de l’Institut CARNOT STAR. L’ITA représentera et présentera CERIMED lors des manifestations organisées par l’Institut CARNOT STAR ou lors des manifestations auxquelles l’Institut CARNOT STAR participe au niveau national et européen, pour la recherche de nouveaux contrats de prestation ou de collaboration pour CERIMED. L’ITA relatera lesactions significatives sur le site Internet de CERIMED ;
Gestion de projets : dans le cadre de prestations ou de projets collaboratifs, l’ITA devra gérer les contrats de prestation en lien avec les parties intéressées (CERIMED, PROTISVALOR, clients et collaborateurs) : répondre aux demandes de renseignements, établir les devis, suivre la facturation, rendre compte de l’avancement des projets, résoudre les litiges ; il devra également gérer les commandes de consommables pour la réalisation des expérimentations.
Participation aux staffs d’équipe et aux staffs recherche du secteur nucléaire préclinique rongeurs de CERIMED, ainsi qu’aux manifestations organisées par CERIMED.

Ingénieur pédagogique imagerie et Physique médicale CDD


L’Ingénieur pédagogique imagerie et Physique médicale (H / F) exercera ses missions au sein du LabEx Primes sous la responsabilité hiérarchique de Thomas Grenier et Bruno Montcel.
Organisation du travail : 37h par semaine (temps complet)
Deux lieux de travail sur le campus de la Doua à Villeurbanne:
- Bâtiment Gustave Ferrié, département de Génie Electrique de l'INSA Lyon
- Laboratoire Creatis, Bâtiment Léonard de Vinci.

Missions principales :
La personne recrutée travaillera en interaction avec les responsables de la plateforme pédagogique et avec les chercheurs du LabEx Primes. Elle développera et pérennisera les différentes modalités d’imagerie médicale (IRM, Ultrason, imagerie ionisante, Optique) présentes sur la plateforme. Elle développera les contenus pédagogiques en lien avec les enseignants du LabEx. Elle développera notamment des outils pédagogiques innovants (MOOC…) en lien avec le service d’innovation pédagogique de L’INSA Lyon. Ses missions comprendront notamment :
- Centralisation et bilan de l'existant de la plateforme pédagogique (matériel, logiciel, supports pédagogiques,…), proposition d'évolutions et transfert vers la nouvelle plateforme pédagogique numérique,
- Aide pour les responsables de plateforme pour les échanges liés aux commandes et la mise en fonctionnement du matériel,
- Appui à la création des nouveaux TP et des supports pédagogiques,
- Communications sur la plateforme et son animation,
- Étude d’enseignements à distance et leur mise en œuvre pour les TP,
- Interaction avec la cellule d’innovation pédagogique ATENA (en charge de la pédagogie "avancée" à INSA) et proposition de supports orientés MOOC ou à formation à distance.

CONDITIONS :
Le salaire sera fixé selon l’expérience de la ou du candidat.e, sur la base de la grille de rémunération en vigueur à l’Université de Lyon, entre l’INM 405 et 597 (entre 23k€ et 34k€ brut annuel). L’employeur prend en charge 50% du coût d’un abonnement aux transports publics dans la limite de 86,16 € par mois (tarif en vigueur au 1er janvier 2019), ainsi qu’une participation forfaitaire de 15 € aux frais des cotisations de protection sociale complémentaire destinées à couvrir les frais de santé.

CDD, Catégorie : A, Corps : IE, Durée de 12 mois prise de fonction au plus tôt

Ingénieur·e d’études en traitement et analyse d’images et de signaux en neurosciences


Missions principales :

Sous l'encadrement du Responsable du service "analyse et traitement d’images" à IRMaGe, vous aurez pour missions de :

- Guider les utilisateurs dans la conception puis dans la mise en œuvre de pipelines de traitement de données IRM (priorité 1) et/ou EEG (priorité 2) à l’état de l’art et adaptées aux hypothèses de recherche des projets ;
- Contribuer au développement et à la mutualisation d’outils ou pipelines développés par les utilisateurs pour faciliter la gestion et l’analyse d’images IRM et/ou de signaux EEG ;
- Participer au contrôle qualité sur les données acquises sur les équipements d’IRMaGe.

Activités principales :

Au sein de UMS IRMaGe :

- Définir et paramétrer des « pipelines » de traitement de référence en IRM (notamment IRM fonctionnelle d’activation et de repos, morphométrie IRM, IRM de diffusion et de connectivité, IRM de perfusion, Spectroscopie IRM) et/ou d’analyse de signaux en EEG (localisation de sources, DCM, potentiels évoqués, analyses temps-fréquences, etc.) ;
- Contribuer à la formation de chercheurs (e.g., formation dans les laboratoires, sur la plateforme IRMaGe) et d’étudiants UGA (e.g., à travers des interventions en Master 2) ;
- Assurer une veille scientifique et technologique sur les méthodes d’analyses, les enjeux de recherche et les outils logiciels disponibles, utiles à la plate-forme et à ses utilisateurs ;
- Intégrer certains « pipelines » de traitement identifiés dans un environnement permettant l’intégration multi-logiciels en rendant l’usage abordable par d’autres utilisateurs ;
- S'impliquer scientifiquement dans l’analyse des données en fonction des demandes des utilisateurs ;
- Participer à des tâches d’intérêt collectif sur la plateforme IRMaGe.
*Des déplacements dans les laboratoires utilisateurs, ainsi que pour des conférences, formations sont à prévoir. Des déplacements occasionnels à l'étranger sont à envisager.

Lien de l'annonce : https://emploi.univ-grenoble-alpes.fr/offres/ingenieur-e-d-etudes-en-traitement-et-analyse-d-images-et-de-signaux-en-neurosciences-1134734.kjsp?RH=1135797159702996

Type de recrutement : Poste ouvert en CDD
Quotité de travail : 100%
Niveau d'emploi : A
Durée du contrat : Du 03 octobre 2022 au 02 octobre 2023

OFFRE EMPLOI STAGE M2 – 6 MOIS – IMAGERIE TEP

Le cycle de vie des cellules tumorales est régi par des protéines dérégulées comme p53, FAK ou SK1 qui sont surexprimées ou inactivées dans un grand nombre de cancers et qui sont facteurs de mauvais pronostic. La tomographie par émission de positrons (TEP) est une technique d’imagerie moléculaire extrêmement sensible qui permettrait, grâce au développement de radiotraceurs marqués au fluor-18, de réaliser à la fois une imagerie pronostique et un suivi thérapeutique de ces cancers.
Les objectifs de ce stage à caractère multidisciplinaire seront :
 de réaliser la synthèse multi-étapes de plusieurs composés fluorés originaux ainsi que les précurseurs de marquage associés pour les différentes cibles mentionnées
 de radiomarquer les composés au fluor-18 et d’automatiser les procédés
 de s’impliquer dans l’imagerie TEP préclinique des radiotraceurs synthétisés

CDD Ingénieur-e de recherche en imagerie multimodale préclinique

Le poste poste à pourvoir est un CDD "agents contractuels / Catégorie A / Corps : IR - ingénieur de recherche / Emploi-Type : C1B42 - - Expert-e en développement d’expérimentation "

Mission principale : La personne recrutée aura pour mission d’assurer la conception et l’adaptation de protocoles expérimentaux mettant en ouvre l’IRM et le microTEP/CT.

Activités principales :
 Etudier les besoins en relation avec les objectifs de recherche, évaluer et proposer des stratégies d’étude et méthodes de caractérisation ou d'observations adaptées
 Discuter de cahier des charges fonctionnelles avec les utilisateurs et rédiger le cahier des charges techniques des projets d’imagerie
 Organiser le suivi de la réalisation des projets d’imagerie, valider et qualifier la ou les méthodologies à mettre en œuvre aux différentes étapes de réalisation (revues de projets)
 Conduire la consultation pour la réalisation du projet expérimental en imagerie du petit animal
 Piloter la réalisation des mesures, les interpréter et les valider
 Gérer l'ensemble des moyens humains, matériels et financiers alloués aux expériences
 Assurer la gestion, le maintien opérationnel des systèmes et le développement de
l'imagerie du petit animal dans l’unité (IRM et microTEP/CT prioritairement)
 Former, informer, conseiller, sur les principes et la mise en œuvre des dispositifs expérimentaux
 Exercer une veille sur les évolutions technologiques du domaine
 Assurer la sécurité de fonctionnement du système
 Gérer en discussion avec la responsable de service l’ensemble des ressources humaines, techniques et financières allouées au service
 Présenter, diffuser et valoriser les résultats expérimentaux
 Participer à la gestion du service d’exploration non invasive du CREFRE en prenant part activement au maintien de son système documentaire qualité
 Assurer la surveillance du bien-être animal dans le cadre des protocoles d’imagerie

Spécificité(s) et environnement du poste :
 Expérimentation sur le petit animal
 Manipulation de sources radioactives non scellées, scellées et générateurs de rayons X
 Travail en environnement confiné
 Horaires flexibles selon les contraintes du service
 Astreintes weekends possibles

Prise de fonction Novembre 2022 d'une durée 12 mois / Temps plein 38.30 heures .

Avantages :
 32 jours de Congés Annuels et 13 jours de RTT
 Restauration collective subventionnée sur place
 Comité d'action et entraide sociale (prestations sociales, culturelles, sportives)
 Transports publics remboursés partiellement

Pour plus d'informations :
Sur l’Inserm : https://www.inserm.fr/ ; site RH : https://rh.inserm.fr/Pages/default.aspx
Sur la politique handicap de l’Inserm et sur la mise en place d’aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap : emploi.handicap@inserm.fr

Chef-fe de projet imagerie-OFSEP

MISSIONS DU/DE LA CHEF-FE DE PROJET

(1) Mettre en place le transfert des IRM au sein des centres participants :
- Participer à l’installation du logiciel ShanoirUploader en lien avec les services informatiques des centres
- Rédiger les guides utilisateurs et former les utilisateurs à l’utilisation du logiciel
- Administrer la plateforme de stockage Shanoir

(2) Assurer le contrôle qualité des images collectées : identification des images, respect des paramètres d’acquisition, etc.
(3) Participer à la conception et à l’amélioration des outils de l’OFSEP (logiciels de transfert et de stockagedes IRM développés par l’équipe Empenn (Inria) de Rennes : ShanoirUploader et Shanoir ;Plateforme OFSEP : (viewer et post-traitement):
- Recueillir et évaluer les besoins des utilisateurs (fonctionnalité, corrections…)
- Rédiger les cahiers des charges des besoins identifiés
- Participer aux tests des versions livrées
- Effectuer la recette des évolutions et corrections

(4) Participer au pilotage du groupe de travail imagerie :
- Organiser les réunions de suivi
- Suivre les actions et décisions et veiller à tenir les délais
- Assurer le lien entre le groupe imagerie et le CCN et rendre compte aux instances de gouvernance de l’OFSEP

(5) Participer à la démarche qualité de l’OFSEP

POSITIONNEMENT DU POSTE
Le/La chef-fe de projet imagerie est membre du CCN. Il/elle travaille sous la responsabilité directe du Responsable Cohorte et en collaboration avec le reste de l’équipe du CCN (chefs de projets, data-manager…), l’équipe Inria membre du groupe de travail et le Responsable du groupe de travail imagerie de l’OFSEP (Pr François Cotton).

Post-doctoral position on Multimodal Machine Learning for PET/CT and PET/MRI Image Reconstruction

Contexte et mission :
Positron Emission Tomography (PET) is a medical imaging modality that measures in vivo biochemical processes that play a key role in the onset and progression of a disease. Main applications of PET are oncology, neurology and cardiology. PET is a functional modality and is always associated with a complementary anatomical modality such as X-ray Computed Tomography (CT) and Magnetic Resonance Imaging (MRI). PET images are obtained by tomographic reconstruction, which is the task of estimating an image from measurement data collected by the acquisition system. PET reconstruction is an ill-posed inverse problem and poor Signal-to-Noise Ratio (SNR) in the collected data translates into degraded image quality. While shorter acquisitions and low-dose are preferable due to time constraints and patient exposure to radiations, they result in lower SNR. The challenge of image reconstruction is therefore to reconstruct an image from a short/low-dose acquisition with acceptable noise.
Recent machine learning techniques for PET reconstruction have pushed towards less noise [1]. They offer the possibility to reduce the patient dose and the acquisition time without degrading the image quality. These techniques are in their infancy and their utilization mostly limited to single modality images. Multimodal machine learning (MML) aims at buildings models that can process and relate information from multiple modalities.
In the MultiRecon project we develop new machine learning reconstruction techniques for PET/CT and PET/MRI multimodal imaging systems. The hypothesis is that combining the raw data from different modalities with machine learning and deep learning based models can further reduce the noise and improve the image quality. More specifically, the candidate will:
• Contribute to the development of new optimization algorithms for multimodal machine learning image reconstruction;
• Integrate these optimization algorithms in the open-source CASToR reconstruction platform [2];
• Apply and evaluate these techniques to PET/CT and PET/MRI data acquired by the project partners.

Post-doctorat Agent d’imagerie TEP /TEMP

We are looking for a highly motivated candidate for a 12-months, full-time postdoctoral position. A solid background in the field of neurobiology and cerebral imaging is expected. Knowledge in the field of nuclear imaging will be appreciated. This project will include in vitro as well in vivo experimentation.

The "Radiopharmaceutiques Biocliniques" laboratory is a research unit of the French National Health Institute (INSERM UMRS_1039). The objectives of this unit are to develop new radiopharmaceuticals for resolving commonly encountered clinical problems in the setting of diagnostic, prognostic or therapeutic strategies. The different research fields of the laboratory are cardiology, metabolism, oncology and neurodegenerative pathologies (https://lrb.univ-grenoble-alpes.fr).

Screening of applications will begin on September 2022 the 1st and position will remain open until filled. Please email your detailed CV including publication list with copies of the most relevant ones, and the names/contact information of two individuals/supervisors who can provide a detailed account of your accomplishments and abilities.

Team : Neurodegenerative Diseases

AAPG ANR 2020 - PRC 30 mois CE17 - Recherche translationnelle en santé. LINOTTE Ligand pour l'Imagerie Nucléaire des Oligomères de la protéine Tau Ligands for Nuclear Imaging of Tau protein Oligomers


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