FLI
Vous trouverez dans cette rubrique les offres de stage, de thèses, de post doctorats, de CDD et CDI à pourvoir dans les laboratoires partenaires du réseau.
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Technicien en expérimentation animale / Technicien en imagerie du vivant
RÉSUMÉ DU POSTE :
L'agent a pour mission principale de réaliser des procédures expérimentales sur le petit animal établies pour la plateforme d'imagerie à rayon X, Micro-CT hébergée par le laboratoire URP2496.
PRÉSENTATION DE LA DIRECTION/STRUCTURE D'ACCUEIL DU POSTE :
Composante de la Faculté de Santé de l'Université Paris Cité, l'UFR d'Odontologie a donné dès son édification, à la recherche biomédicale, une place prépondérante en créant et en soutenant le développement de laboratoires au sein desquels les enseignants et les étudiants participent à des projets de recherche clinique fondamentale. L'UFR d'Odontologie Université Paris Cité est l’une des quinze UFR d'odontologie de France.
DESCRIPTIF DES ACTIVITÉS :
- Effectuer des expérimentations sur animaux en respectant le protocole préétabli ;
- Acquisitions sur animaux vivants ou échantillons et traitement des données Micro-CT ;
- Surveiller statuts sanitaires et de santé des animaux et faire administrer les traitements prescrits ;
- Préparer et traiter des échantillons en vue de leur analyse par imagerie à rayon X ;
- Appliquer les réglementations du domaine d'étude ;
- Recueillir et mettre en forme les informations nécessaires à la bonne conduite de l'expérimentation ou requises par la législation ;
- Tenir un cahier de laboratoire et rédaction de protocoles ;
- Gérer les stocks et les commandes ;
- Assurer l'entretien et la maintenance de premier niveau du matériel et des équipements ;
- Participation à la gestion administrative de l'animalerie (logiciel, stocks, médicaments, saisine APAFIS...).
Encadrement : Oui
Conditions particulières d'exercice
- Utiliser les appareillages dédiés nécessaires (Micro- CT haute résolution, appareil anesthésie isofluorane...)
- Utiliser les logiciels liés aux techniques d'analyse des images.
Chef(fe) de projet ISEULT
La mission du (de la) chef(fe) de projet, à l’orée de la mise en exploitation de l’IRM, prendra plusieurs
aspects :
Planification du projet : Mise à jour des plannings (court terme - semaine, moyen terme - 1 an, long terme - 5 ans) après discussion avec les experts "aimant" de l’IRFU et "imagerie" METRIC.
Reporting : Rendre compte des avancées du projet en interne et en externe en préparant et animant les COPIL (Comité de Pilotage réunissant les partenaires du projet) et les réunions inter-instituts CEA, ainsi qu’en élaborant le rapport requis par la BPI, financeur du projet.
Gestion de projet : assister le pilote stratégique dans le bon déroulement du projet et sa coordination globale, assurer le suivi budgétaire, et le présenter devant la hiérarchie du CEA.
Actions de communication : en lien avec les responsables communication et le Service Presse CEA, diffuser régulièrement des informations dans « la lettre de l’Institut Joliot » ( Institut de recherche auquel appartient NeuroSpin) , au travers de faits marquants aux étapes importantes du projet, et préparer les évènements associés au projet avec les directions impliquées (ex : la première image chez l'homme).
Aspects réglementaires : l’objectif à court terme reste d’obtenir l’autorisation des organismes certificateurs pour l’imagerie sur l’homme à cette intensité de champ magnétique. Le(La) chef(fe) de projet aura un rôle essentiel dans la production de ce dossier et son suivi tout au long de la procédure en faisant en particulier le lien entre les différents intervenants participants à la production des justificatifs en interne : physiciens, biologistes, médecins, personnels administratifs du CEA, et en externe - CRO (Contract Research Organization) prestataire de service pour le projet, et les autorités décisionnaires sur ce dossier : ANSM (Agence Nationale de Sécurité du Médicament et produits de santé) et Comité de Protection des Personnes (CPP) sous la direction du médecin responsable. Une fois cette autorisation obtenue, le(la) chef(fe) de projet sera aussi en première ligne pour rédiger le premier protocole de recherche clinique puis de le maintenir ou de le faire évoluer.
Maintenabilité du système : le(la) chef(fe) de projet sera en charge d’entretenir une relation étroite avec l’IRFU, Siemens Healthineers (fournisseur de l’instrumentation RMN) et l’équipe plateforme de NeuroSpin (dont la cellule maintenance) afin de maintenir l’appareil en opération. Cela implique également le suivi des contrats de maintenance des équipements d’imagerie et
leur renouvellement.
Gestion et suivi des Procédures Achats : L’évolution de l’instrumentation d’ISEULT, soutenue par un financement EQUIPEX, impliquera des achats conséquents, le/la chef(fe) de projet ISEULT rédigera les cahiers des charges des appareils choisies/évolutions en collaboration avec les responsables de ce financement puis assurera, en lien avec le service commercial du CEA le suivi de ces dossiers, les procédures achats, et fera évoluer les contrats de maintenance induits le cas échéant. Au fur et à mesure que le système rentrera dans une phase d’exploitation normale, le poste évoluera avec de nouvelles missions :
D’abord celle de renforcer les collaborations existantes et développer de nouveaux partenariats industriels et académiques afin de soutenir la rédaction de réponses aux appels à projets européens tels que le programme Horizon Europe (dont ERC, IEC Pathfinder, etc...) ou ANR, en d’autres termes participer à la création d’une dynamique porteuse de nouveaux projets de recherche avec le responsable scientifique du programme. Cela peut vouloir dire mettre en place des contrats de collaboration, en lien avec le service juridique du CEA, et suivi des projets.
Il s’agira aussi et d’animer la communauté des utilisateurs d'Iseult (organisation des réunions régulières et d'intérêt général sur Iseult). De plus, le (de la) chef(fe) de projet mettra en place des formations techniques destinées aux chercheurs de NeuroSpin mais également aux équipes extérieures qui seront amenées à travailler sur l’IRM à 11.7T afin de faciliter le démarrage d’études sur ce système et de garantir la qualité des résultats obtenus.
Ensuite, selon le parcours professionnel et les compétences du (de la) titulaire, d’autres voies seront possibles ; Par exemple, il serait possible qu’il/elle mette en place son propre projet de recherche en symbiose avec les activités des physiciens de l’équipe METRIC.
Ingénieur de Recherche en IRM CDD
Vous participerez à la conception, l’optimisation et la mise en place des protocoles expérimentaux ainsi qu'à l’acquisition et l’analyse à des données.
Vous développerez une expertise des outils logiciels existants adaptés à l'analyse des données IRM produites sur la plate-forme et participerez à l’exploitation et à l'évolution de dispositifs expérimentaux du plateau IRM 3T.
Vous travaillerez en collaboration et sous l'autorité de Laurent LAMALLE, physicien spécialisé en IRM, en concertation avec le Professeur Alexandre KRAINIK, neuroradiologue responsable de la composante clinique et cognitive et également en collaboration avec J. WARNKING, chercheur physicien spécialiste IRM, J. PIETRAS, L. MIQUEL, ingénieur hospitalier et manipulatrice en électroradiologie et Éric CONDAMINE, Ingénieur de Recherche "développements logiciels / traitement d'images".
Activités principales :
- Vous participerez à la conception et à la mise en place des protocoles de recherche et pour cela,
vous participerez à l'optimisation des acquisitions, de leur analyse, à la validation du protocole.
vous étudierez les besoins scientifiques, proposerez les techniques et méthodes de mesure, de caractérisation ou d'observations adaptées.
vous étudierez les projets et conseillerez les utilisateurs pour assurer la faisabilité du protocole en analysant les contraintes expérimentales et proposerez les adaptations et évolutions nécessaires de la chaîne expérimentale.
vous participerez au développement de séquences d’acquisition IRM (après formation spécifique).
vous participerez au développement ou à l'intégration des systèmes expérimentaux de la plate-forme (typiquement : périphériques compatibles IRM, voire scanner IRM lui-même).
- Vous participerez aux acquisitions et les encadrerez :
vous formerez à l’utilisation des dispositifs expérimentaux.
vous analyserez, interpréterez, validerez les données.
vous vous impliquerez scientifiquement dans l’analyse des données des utilisateurs.
vous participerez à et encadrerez la sauvegarde des données.
- Vous suivrez et rapporterez le déroulement des protocoles :
vous maintiendrez à jour le tableau de bord du déroulement des protocoles.
vous veillerez au fonctionnement et à la sécurité des dispositifs expérimentaux.
- Vous participerez au développement d'une expertise dans l'analyse des données produites sur la plate-forme :
- Vous explorerez et évaluerez des données acquises sur la plate-forme et des outils de traitement adaptés à ces données.
vous participerez à la veille scientifique et technologique et sa structuration, en particulier concernant les outils de traitement et analyse d’images et de signaux utiles à la plate-forme et à ses utilisateurs, vous conseillerez ceux-ci.
vous définirez des « pipelines » de traitement de référence, proposerez des solutions d’analyse « clés en main » et « à l'état de l'art » des données produites sur la plate-forme adaptées aux hypothèses de recherche de ses utilisateurs.
vous intégrerez certains « pipelines » de traitement identifiés comme prioritaires dans un environnement en rendant l’usage abordable par d’autres utilisateurs. Vous participerez au développement des services de traitement et d’analyse d’images et de signaux.
En fonction des demandes des utilisateurs (cliniciens, chercheurs ou industriels), vous irez jusqu’à vous impliquer scientifiquement dans l’analyse de leurs données.
- Vous présenterez, diffuserez et valoriserez les réalisations du plateau.
- Vous serez amener à interagir avec les ingénieurs des plateaux analogues en France et à l'international.
Post-doctorant en biologie
Le/la post-doctorant/e recruté/e aura pour mission d’évaluer les propriétés in vitro (toxicité cellulaire, hémolyse...) et in vivo (biodistribution, clairance métabolique) des outils diagnostiques préparés dans le cadre de ce projet. De plus, il/elle participera à la démonstration de leur utilisation in vivo en IRM du xénon hyperpolarisé chez le rongeur au GIP CYCERON.
Ingénieur de recherche en RMN
L’ingénieur de recherche aura pour mission de caractériser les interactions entre le xénon et différents hôtes (moléculaires, nanoémulsions,…), afin d’apporter la preuve de concept de leur utilisation en IRM du xénon hyperpolarisé. La personne recrutée
réalisera les études in vitro en RMN du xénon (Thermique et/ou hyperpolarisé), et devra poursuivre la mise en place du xénon hyperpolarisé au centre d’imagerie GIP CYCERON.
Coordination du Hub Ouest de l’infrastructure nationale France Life Imaging
Pour soutenir le coordinateur du hub Grand-Ouest, l’Université Rennes 1 recrute en CDD un.e chargé.e de mission pour son action d’animation du hub et de renforcement du lien avec les autres hubs régionaux.
Les missions suivantes seront confiées au/à la chargé.e. de mission :
• Animation de la coordination inter-régionale : Organisation des réunions du COPIL régional au moins trimestrielles avec ordre du jour et compte-rendu, lien avec les actions des Réseaux d’expertise de FLI conduites au niveau national, notamment les appels à projets relatifs aux échanges d’expertise entre les plateformes nationales,
• Le lien avec la coordination nationale : Avec le coordinateur du Hub, diffusion des informations du COPIL national lors des réunions du COPIL régional, remontée au COPIL national des besoins/attentes des plateformes, mise à jour annuelle de la feuille de prospective FLI recensant les besoins en équipements d’imagerie
• Lien avec les réseaux régionaux : Participer aux actions conduites dans le cadre du réseau Biogenouest en soutien de la stratégie du Hub et de ses plateformes
• L’harmonisation de la gestion des plateformes au sein du hub : Mise en place d’outils communs : ex fiches projets, outils de réservation des PF, harmonisation de la démarche qualité (ISO, check up qualité...), indicateurs de l’utilisation des plateformes, reporting sur l’activité des plateformes
• La communication/visibilité des plateformes : définition de l’offre plateforme régionale, construction de support de communication, organisation et participation à des évènements régionaux et nationaux de promotion du Hub
• Mise en œuvre de l’animation scientifique au sein du hub : appuyer le coordinateur et les responsables de plateforme dans la structuration et l’organisation d’une animation scientifique au sein du Hub en interaction avec les autres infrastructures nationales.
Le contrat débute en novembre 2022 pour une durée de 24 mois, prolongeable jusqu’à 4 ans maximum
La mission confiée permettra au collaborateur d’être au cœur des enjeux de la recherche au travers de la structuration des plateformes. Il/elle sera directement en lien avec des experts mobilisés au sein d’un réseau régional composé de plus d’une trentaine de plateformes, il sera impliqué dans le réseau national France Life Imaging.
Ingénieur de recherche du programme ANDIMBA – CDD 18 Mois
BAP : BAP A : « Science de la vie, de la Terre et de l’environnement » / FAP « Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre »
Missions :
Adaptation et mise en œuvre d’outil de neuroanatomie informatisée, traitement et analyse de données IRM anatomiques, dans le cadre du programme ANDIMBA (ANR-19-CE17-0028-01, Spectre de l’Alcoolisation Fœtale : identification de marqueurs neuro-anatomiques en IRM), en collaboration avec l’investigateur principal et les investigateurs associés. La mission comprend la participation aux trois tâches suivantes du programme :
• adaptation d’outils de traitement d’images adaptés aux objectifs et données du programme
• traitement des images IRM pour obtention des paramètres neuroanatomiques d’intérêt
• identification de marqueurs par analyse normative et modélisation prédictive multivarié
Activités principales :
• Traitement des images IRM (patients, contrôles) pour estimation de paramètres d’intérêt :
- application d’un nouvel outil de mesure non supervisée du corps calleux (étude princeps)
- adaptation et application de 2 outils de segmentation des hémisphères cérébraux
• Analyse comparative (patients, contrôles) et intégrative des paramètres neuroanatomiques :
- modélisation des effets de taille et/ou de croissance pour analyse normative et identification de paramètres « candidat
marqueur »
- modélisation multimarqueur (classifieur, prédicteur…) incluant l’ensemble des résultats du projet ANDIMBA sur la base d’outils d’apprentissage informatisé
Activités associées :
• Contribution à l’étude d’autres paramètres ou structures neuroanatomiques (noyaux gris)
• Contribution éventuelle à l’encadrement des stagiaires en M2 du programme
• Contribution à la rédaction et publication d’au moins un article scientifique sur ces travaux
Spécificité(s) / Contrainte(s) du poste :
Site d’exercice : principalement à NeuroSpin (CEA-Saclay, Gif/Yvette), potentiellement à l’INT (Marseille) sous forme de mission, très accessoirement à hôpital Robert-Debré (Inserm U1141 NeuroDiderot, Paris 19e ), télétravail selon réglementation de l’Inserm.
Engineer position at the European Center for Research in Medical Imaging – Marseille
- Use of animals for scientific purposes: caudal, retroorbital, subcutaneous, intramuscular and intraperitoneal intravenous injection, fluid samples from living rodents (mice, rat);
- Handling of radiotracers (notions of decay, radiation protection);
- Preclinical isotopic imaging in vivo microSPECT/CT, microPET/CT: preparation of rodents, acquisition of static and dynamic images, image processing (reconstruction, quantification), presentation of imaging data for statistical analysis;
- Project management and quality assurance: general notions of project management and quality management, traceability, confidentiality / GDPR, in conjunction with the CERIMED quality unit.
Ingénieur Technicien Administratif Marseille CDD 12 mois
Imagerie isotopique préclinique in vivo microTEMP/TDM, microTEP/TDM : dans le cadre de prestations ou de projets collaboratifs de recherche portés par CERIMED avec le monde académique et industriel, l’ITA devra gérer en autonomie le prélèvement des doses individuelles de radiotraceur, l’administration aux rongeurs, l’acquisition microTEMP/TDM ou microTEP/TDM, le traitement des images ainsi que leur analyse statistique ;
Valorisation et diffusion : l’ITA sera en lien avec le représentant de CERIMED au COMEX de l’Institut CARNOT STAR ainsi qu’avec les chargés d’affaires de l’Institut CARNOT STAR. L’ITA représentera et présentera CERIMED lors des manifestations organisées par l’Institut CARNOT STAR ou lors des manifestations auxquelles l’Institut CARNOT STAR participe au niveau national et européen, pour la recherche de nouveaux contrats de prestation ou de collaboration pour CERIMED. L’ITA relatera lesactions significatives sur le site Internet de CERIMED ;
Gestion de projets : dans le cadre de prestations ou de projets collaboratifs, l’ITA devra gérer les contrats de prestation en lien avec les parties intéressées (CERIMED, PROTISVALOR, clients et collaborateurs) : répondre aux demandes de renseignements, établir les devis, suivre la facturation, rendre compte de l’avancement des projets, résoudre les litiges ; il devra également gérer les commandes de consommables pour la réalisation des expérimentations.
Participation aux staffs d’équipe et aux staffs recherche du secteur nucléaire préclinique rongeurs de CERIMED, ainsi qu’aux manifestations organisées par CERIMED.
Ingénieur pédagogique imagerie et Physique médicale CDD
L’Ingénieur pédagogique imagerie et Physique médicale (H / F) exercera ses missions au sein du LabEx Primes sous la responsabilité hiérarchique de Thomas Grenier et Bruno Montcel.
Organisation du travail : 37h par semaine (temps complet)
Deux lieux de travail sur le campus de la Doua à Villeurbanne:
- Bâtiment Gustave Ferrié, département de Génie Electrique de l'INSA Lyon
- Laboratoire Creatis, Bâtiment Léonard de Vinci.
Missions principales :
La personne recrutée travaillera en interaction avec les responsables de la plateforme pédagogique et avec les chercheurs du LabEx Primes. Elle développera et pérennisera les différentes modalités d’imagerie médicale (IRM, Ultrason, imagerie ionisante, Optique) présentes sur la plateforme. Elle développera les contenus pédagogiques en lien avec les enseignants du LabEx. Elle développera notamment des outils pédagogiques innovants (MOOC…) en lien avec le service d’innovation pédagogique de L’INSA Lyon. Ses missions comprendront notamment :
- Centralisation et bilan de l'existant de la plateforme pédagogique (matériel, logiciel, supports pédagogiques,…), proposition d'évolutions et transfert vers la nouvelle plateforme pédagogique numérique,
- Aide pour les responsables de plateforme pour les échanges liés aux commandes et la mise en fonctionnement du matériel,
- Appui à la création des nouveaux TP et des supports pédagogiques,
- Communications sur la plateforme et son animation,
- Étude d’enseignements à distance et leur mise en œuvre pour les TP,
- Interaction avec la cellule d’innovation pédagogique ATENA (en charge de la pédagogie "avancée" à INSA) et proposition de supports orientés MOOC ou à formation à distance.
CONDITIONS :
Le salaire sera fixé selon l’expérience de la ou du candidat.e, sur la base de la grille de rémunération en vigueur à l’Université de Lyon, entre l’INM 405 et 597 (entre 23k€ et 34k€ brut annuel). L’employeur prend en charge 50% du coût d’un abonnement aux transports publics dans la limite de 86,16 € par mois (tarif en vigueur au 1er janvier 2019), ainsi qu’une participation forfaitaire de 15 € aux frais des cotisations de protection sociale complémentaire destinées à couvrir les frais de santé.
CDD, Catégorie : A, Corps : IE, Durée de 12 mois prise de fonction au plus tôt