FLI
Vous trouverez dans cette rubrique les offres de stage, de thèses, de post doctorats, de CDD et CDI à pourvoir dans les laboratoires partenaires du réseau.
Liste des annonces
2017/04/12- CDD (3 ans) -CHERCHEUR TRAITEMENT ET ANALYSE D’IMAGES
L’Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA) ouvre à partir du 1er septembre 2017 un poste de chercheur contractuel dans le domaine de l’imagerie et du retraitement et analyse d’images de microscopie bi-photonique et à fluorescence. CDD 3 ans renouvelable une fois avant CDisation.
Missions :
- Concevoir les méthodes d’acquisition et améliorer les protocoles d’acquisition des images in situ et in vivo,
- Compétence en optique,
- Concevoir, développer et exploiter des programmes de traitement et d’analyse d’images (segmentation, recadrage temporel et compensation de dérive, tracking de cellules/particules, reconstruction 3D, distribution et reconnaissance de forme, statistique en imagerie, etc),
- Assurer l’amélioration des programmes par l’écriture et l’implémentation d’algorithmes en fonction des besoins des projets de recherche.
2017/04/10 Research Engineer, Caen
The engineer will be in charge of the implementation of open access databases related to aging and neurodegenerative disease (e.g., ADNI, DIAN) within the team and of the development of new methods of (pre)processing neuroimaging data. More specifically, the engineer will have to set databases for use, implement quality control procedure for different imaging modalities (e.g., structural and functional MRI, PET) and connect together the different databases. Moreover, the engineer will be involved in the development of innovative processing and analyses techniques for one or several of the neuroimaging data modalities acquired in the lab (e.g., fMRI, DTI, ASL, PET imaging).
Duration : 12 to 36 months
Starting date : 01/06/2017
To apply : Send a CV, motivation letter and contact details of two academic referees
2017/01/19 Ingénieur en analyse et traitement d’images IRM, Caen
L’Etat de Repos chez le petit animal est un état cérébral mental physiologique particulier qui correspond aux périodes aux cours desquelles le cerveau fonctionne sans entrée, consigne ou sortie forcée. Ces périodes d’état de repos représentent une fraction notable de la période d’éveil, et peuvent aussi bien s’étendre sur de longues plages temporelles (plusieurs minutes) que durer de brefs instants. Outre l’intérêt que présente en soi la connaissance des bases neurales de cet état cérébral, celle-ci se révèle par ailleurs indispensable pour effectuer une analyse fine des données de neuroimagerie cognitive. En effet, en neurosciences cognitives et en neuroimagerie particulièrement, l’état de repos est fréquemment employé, explicitement ou implicitement, comme état de référence dans les paradigmes expérimentaux. Les bases neurales de cet état cérébral particulier font donc l’objet depuis quelques années d’un intérêt croissant.
Développements :
Le but de ce CDD est de fournir une toolbox informatique accessible pour faciliter les méthodes d’extraction de l’information sur une base de données d’imagerie. Cette mission s’articule donc autour des points suivants :
• Mise en place d’une structure de base de données relationnelle : description de la donnée, traçabilité des traitements, stockage des résultats.
• Automatisation des traitements d’images : recalage spatial, normalisation stéréotaxique, filtrage spatial et temporel, …
• Automatisation de l’analyse en composante indépendante (ICA) pour établir une cartographie cérébrale fonctionnelle.
• Développement d’outil de navigation dans les images : recalage manuel, superposition d’images, …
• Mise en place d’une représentation par graphe de la connectivité fonctionnelle sur la base de corrélation basse fréquence entre les différentes régions identifiées par l’analyse ICA.
• Développements d’outil d’analyse de graphe : comparaison de graphe, degrés, betweenness centrality, …
Outils : Matlab, Cshell, FSL, JMP, R, MySQL, SGE.
2017/01/04 France Life Imaging recrute un chargé de mission, Paris
Le réseau national France Life Imaging (FLI) recherche un chargé de mission pour assurer
- l’animation et la coordination du noeud Paris Centre du réseau (20%)
- la coordination de la formation des personnels et des étudiants du réseau (40%)
- la communication nationale (40%)
Activités principales
- Noeud Paris Centre : gestion des interactions entre les plates-formes et laboratoires de recherche du noeud, suivi des projets et partenariats du guichet national, reporting, suivi du planning, du budget, soutien à la qualité et à la tarification, animation du noeud
- Work Package Formation : soutien à la mise en place des formations en lien avec l’INSTN et les organismes de formation continue des tutelles de FLI, suivi du budget, reporting, organisation opérationnelle des actions du work package, soutien et animation
du réseau français des jeunes imageurs
- Communication nationale : mise à jour du site internet, rédaction et diffusion de la newsletter, organisation de manifestations scientifiques, mise à jour de la mailing list, création de supports de communication (plaquettes, posters, …)
CDD de 12 à 18 mois.
2017/01/04 France Life Imaging recrute un chargé de mission, Paris
Le réseau national France Life Imaging (FLI) recherche un chargé de mission pour assurer
- l’animation et la coordination du noeud Paris Centre du réseau (20%)
- la coordination de la formation des personnels et des étudiants du réseau (40%)
- la communication nationale (40%)
Activités principales
- Noeud Paris Centre : gestion des interactions entre les plates-formes et laboratoires de recherche du noeud, suivi des projets et partenariats du guichet national, reporting, suivi du planning, du budget, soutien à la qualité et à la tarification, animation du noeud
- Work Package Formation : soutien à la mise en place des formations en lien avec l’INSTN et les organismes de formation continue des tutelles de FLI, suivi du budget, reporting, organisation opérationnelle des actions du work package, soutien et animation
du réseau français des jeunes imageurs
- Communication nationale : mise à jour du site internet, rédaction et diffusion de la newsletter, organisation de manifestations scientifiques, mise à jour de la mailing list, création de supports de communication (plaquettes, posters, …)
CDD de 12 à 18 mois.
2017/01/03 Ingénieur plateforme IMOSAR, Paris
L’ingénieur d’études du laboratoire Bioingénierie et Bioimagerie Ostéo-Articulaire (B2OA) devra faire fonctionner la plateforme d’imagerie IMOSAR (imagerie en recherche dans le domaine de l’ostéo-articulaire) focalisée sur l’imagerie multi-échelle dérivée des rayons X. La plateforme compte 2 micro-scanners type Skyscan 1172® et 1176® le premier dédié aux biomatériaux et pièces anatomiques et l’autre à l’imagerie préclinique.
CDD d'1 an renouvelable.
Activités
- Gérer le planning de la plateforme
- Assurer la formation et le support auprès des utilisateurs extérieurs (chercheurs et médecins) sur les appareils
- Assurer la formation des chercheurs aux outils de traitement d’image connexes à l’utilisation des appareils
- Assurer le suivi des opérations de maintenance des appareillages.
- Responsable de l’archivage des données et du bon fonctionnement des appareils
- Rédiger des procédures simples pour les utilisateurs
- Aider les chercheurs de l’équipe dans la réalisation de leur projet dans le domaine de l’imagerie
Compétences
Savoir généraux :
- Bases physiques sur les rayons X
- Maîtriser les systèmes d'exploitation Windows
- Maitriser les outils informatiques excell, word, power point.
- Maîtrise de l’anglais suffisante pour comprendre et interpréter la documentation et les modes d’emploi relatifs aux appareils, pouvoir communiquer avec les interlocuteurs anglophones développeurs
-Maîtrise de logiciels de traitement d’image tel qu’image J , AMIRA serait un plus
Savoir-faire opérationnel :
- Avoir de bonnes capacités de dialogue et d'écoute en particulier à l'interface entre ingénieurs et milieu médical
- Aptitude relationnelle
- Aptitude pédagogique
- Faire preuve de capacités d'organisation
- Savoir rédiger de la documentation technique adaptée aux utilisateurs
2017/01/03 Ingénieur plateforme IMOSAR, Paris
L’ingénieur d’études du laboratoire Bioingénierie et Bioimagerie Ostéo-Articulaire (B2OA) devra faire fonctionner la plateforme d’imagerie IMOSAR (imagerie en recherche dans le domaine de l’ostéo-articulaire) focalisée sur l’imagerie multi-échelle dérivée des rayons X. La plateforme compte 2 micro-scanners type Skyscan 1172® et 1176® le premier dédié aux biomatériaux et pièces anatomiques et l’autre à l’imagerie préclinique.
CDD d'1 an renouvelable.
Activités
- Gérer le planning de la plateforme
- Assurer la formation et le support auprès des utilisateurs extérieurs (chercheurs et médecins) sur les appareils
- Assurer la formation des chercheurs aux outils de traitement d’image connexes à l’utilisation des appareils
- Assurer le suivi des opérations de maintenance des appareillages.
- Responsable de l’archivage des données et du bon fonctionnement des appareils
- Rédiger des procédures simples pour les utilisateurs
- Aider les chercheurs de l’équipe dans la réalisation de leur projet dans le domaine de l’imagerie
Compétences
Savoir généraux :
- Bases physiques sur les rayons X
- Maîtriser les systèmes d'exploitation Windows
- Maitriser les outils informatiques excell, word, power point.
- Maîtrise de l’anglais suffisante pour comprendre et interpréter la documentation et les modes d’emploi relatifs aux appareils, pouvoir communiquer avec les interlocuteurs anglophones développeurs
-Maîtrise de logiciels de traitement d’image tel qu’image J , AMIRA serait un plus
Savoir-faire opérationnel :
- Avoir de bonnes capacités de dialogue et d'écoute en particulier à l'interface entre ingénieurs et milieu médical
- Aptitude relationnelle
- Aptitude pédagogique
- Faire preuve de capacités d'organisation
- Savoir rédiger de la documentation technique adaptée aux utilisateurs
2016/11/21 Post-doctoral position : Image analysis and brain magnetic resonance imaging, Tours
The position is dedicated to MRI image analysis in small (rats) and large (sheep) animal models. The project aims to compare brain morphometric (mainly Voxel-Based Morphometry) changes according to the reproductive cycle (virgin, early and late gestation, post-partum). The laboratory is equipped with all state of the art imaging facilities for large animals (CIRE platform: http://www6.val-de- loire.inra.fr/cire) including a 3T-MRI and a CT scan.
The position is initially for one year but extension up to 3 years in total is possible (funding: French national research agency and regional council).
Ideally the position will start beginning of 2017.
Only candidates with a very high motivation will be selected.
Chargé de mission pour France Life Imaging, Paris
Dans un environnement multidisciplinaire, le chef de projet a pour mission principale, sous l’autorité des coordinateurs principal et exécutif et des responsables scientifiques du projet (national), de développer les partenariats entre les plateformes FLI et les partenaires académiques et industriels nationaux et européens ainsi que d’animer le réseau.
La Mission est organisée en cinq tâches principales :
- Prospection de clients pour FLI : Cette tâche (1,5 jour par semaine) aura pour objectif la valorisation des services et ressources nouvelles offerts par les plateformes et services communs, des compétences et savoir-faire proposés auprès de clients potentiels de FLI.
- Gestion du guichet national : Cette tâche (1 jour par semaine) de coordination et de relai aura pour finalité la mise en oeuvre et le suivi des projets, la gestion des procédures d’accès aux clients des plateformes, la mise en place des contrats multi-noeuds ; la gestion de la propriété industrielle et des relations avec les industriels pour les contrats nationaux.
- Gestion des interactions avec les noeuds et les Work Packages (WP) de FLI : Cette tâche (1 jour par semaine) vise à assurer un point de contact pour les utilisateurs et le suivi de leurs projets.
- Gestion des interactions scientifiques et techniques avec le back office et le front office ANR : Cette dernière tâche (0,5 jour par semaine) a pour objectif d’assurer un point pivot pour les échanges ponctuels avec l’ANR relatifs à la communication et à la coordination nationale.
- Communication : cette tâche (1 jour par semaine) aura pour objectif l’exploitation du site Web, la newsletter, mailing, l’événementiel mis en place dans le cadre du projet FLI.
CDD de 18 mois.
Chargé de mission pour France Life Imaging, Paris
Dans un environnement multidisciplinaire, le chef de projet a pour mission principale, sous l’autorité des coordinateurs principal et exécutif et des responsables scientifiques du projet (national), de développer les partenariats entre les plateformes FLI et les partenaires académiques et industriels nationaux et européens ainsi que d’animer le réseau.
La Mission est organisée en cinq tâches principales :
- Prospection de clients pour FLI : Cette tâche (1,5 jour par semaine) aura pour objectif la valorisation des services et ressources nouvelles offerts par les plateformes et services communs, des compétences et savoir-faire proposés auprès de clients potentiels de FLI.
- Gestion du guichet national : Cette tâche (1 jour par semaine) de coordination et de relai aura pour finalité la mise en oeuvre et le suivi des projets, la gestion des procédures d’accès aux clients des plateformes, la mise en place des contrats multi-noeuds ; la gestion de la propriété industrielle et des relations avec les industriels pour les contrats nationaux.
- Gestion des interactions avec les noeuds et les Work Packages (WP) de FLI : Cette tâche (1 jour par semaine) vise à assurer un point de contact pour les utilisateurs et le suivi de leurs projets.
- Gestion des interactions scientifiques et techniques avec le back office et le front office ANR : Cette dernière tâche (0,5 jour par semaine) a pour objectif d’assurer un point pivot pour les échanges ponctuels avec l’ANR relatifs à la communication et à la coordination nationale.
- Communication : cette tâche (1 jour par semaine) aura pour objectif l’exploitation du site Web, la newsletter, mailing, l’événementiel mis en place dans le cadre du projet FLI.
CDD de 18 mois.