Offres d'emploi

Date de l'annonce : jeudi 27 février 2020

Intitulé du poste : 2020/02/27 – CDI Ingénieur plateforme big data pour la neuroimagerie

Type de structure : Equipe d’accueil
Neurospin : centre de recherche pour l'innovation en imagerie cérébrale de l’Université Paris-Saclay.
(http://www.cea.fr/drf/joliot/recherche/neurospin)

Contexte et mission : La mise en place au CEA d’une plateforme pour la médecine du futur va nécessiter, non seulement, le
développement d’une infrastructure importante au Très Grand Centre de Calcul du CEA (TGCC)
pour héberger du stockage et des moyens de calcul, mais également la création d’un portail métier
développé à Neurospin pour les besoins propres à l’univers de la neuroimagerie. Ce portail sera
principalement composé de services et d’outils logiciels qui serviront d’interface entre les chercheurs
du CEA et d’ailleurs et l’infrastructure du TGCC. Il permettra de fluidifier l’analyse des très grandes
bases de données comme UK Biobank (100 000 sujets), ou des agrégations complexes de bases de
données issues de la plateforme CATI (https://cati-neuroimaging.com/).
Ce poste a pour but de permettre la mise en place, la maintenance et l’évolution de cette plateforme
métier afin de répondre aux défis suivants :
 Amener la communauté du big data vers la neuroimagerie, en mettant à disposition de
grands gisements de données annotées et les moyens de calcul adéquats.
 Harmonisation des données et des méta-données. La réutilisation des données et des logiciels
par différents chercheurs étant un aspect important de la plateforme, il est indispensable de
fournir les outils permettant d’assurer une cohérences entre les organisations des données et des
métadonnées des différentes études.
 Gestion des droits. Les bases de données collectées par le CATI n’appartiennent pas au CEA.
Un des objectifs de la plateforme est de créer un cloud mis à disposition des utilisateurs de
chaque base avec des droits sous la responsabilité de chaque promoteur. Ce service nécessite
des développements conséquents.
 Développement logiciel et sécurité. Les logiciels de recherche sont en constante évolution. La
plateforme métier devra apporter le meilleur compromis entre, d’une part, les chercheurs qui
souhaitent pouvoir modifier très librement le coeur des logiciels et, d’autre part, l’utilisation des
logiciels dans une plateforme exigeant un haut niveau de sécurité.

Lieu : Neurospin CEA Paris-Saclay 91191 Gif Sur Yvette

Rémunération : Selon expérience

Diplômes requis : Ingénieur en informatique ou équivalent

Compétences requises :  Maîtrise des systèmes GNU/Linux.  Expérience dans le domaine du calcul intensif.  A l’aise avec les technologies web (HTML, CSS, Javascript, services web, etc.)  Expérience en programmation Python.  Rigueur et bonnes aptitudes relationnelles.  La connaissance des technologies suivantes serait un plus : Git, SQL, méthodes agiles, intégration continue.

Contact : Yann Cointepas yann.cointepas[at]cea.fr

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